门头沟区妇幼保健院是门头沟区一所二级甲等专科妇幼保健机构，前身为妇幼保健所，成立于1978年。从1990年开始，妇幼保健所在全门头沟区内开展孕产妇死亡监测、围产儿、0-6岁儿童死亡监测工作。

1992年9月17日门头沟区妇幼保健所顺利通过市卫生局、市民政局、市计生指导所婚检工作验收，被定于门头沟区婚检保健单位。1995年7月1日开始，全区范围内开展婚前检查工作，区内婚前检查覆盖率达到100%。1998年8月，经门头沟区编办批准更名为妇幼保健院。同年9月妇幼保健院新址竣工投入使用。业务用房2500平方米，开放床位30张，科室18个，主要承担着门头沟区妇幼保健、计划生育等工作，是门头沟区妇幼保健业务指导中心和技术培训中心。

1999年8月-9月先后通过北京市卫生局爱婴医院及助产单位验收工作。2000年7月通过北京市卫生局二级甲等妇幼保健院的验收。2007年4月，通过ISO9001质量管理体系认证，成为门头沟区卫生系统家通过此项质量认证的医疗单位。2008年，医院面积扩展至3900平方米。

近年来，门头沟区妇幼保健院又增加了不孕不育门诊，乳腺防治门诊，孕妇学校，婴幼儿感统园，计划生育手术服务中心，中医门诊等特色科室，为妇女、儿童的健康提供更多的服务。

门头沟区妇幼保健院以“和谐、仁爱、创新、超越”的服务理念及合理的收费为广大就医者及社会各界人士提供一流的医疗服务，信守“母亲安全、儿童优先”的原则，一切以病人为中心，以精湛的医术、优质的服务为广大妇女儿童服务。